科研处下设体育科学研究中心（水上运动科学重点实验室）、学术管理科和防反兴奋剂办公室。现有专职科研人员14名，其中正高职称1人，副高职称1人，硕士生导师1人，博士研究生1人，硕士研究生9人。

主要职能包括负责全院的反兴奋剂工作；负责组织科研人员在各竞技体育系开展科技服务与科研攻关；负责归口管理下设体育科研中心和水上运动科学重点实验室；负责组织全院各级各类科研项目、科研成果的申报与管理工作；负责全院学术交流活动管理以及学术委员会的日常工作等；做好学院领导交办的其他工作。